Propanona: julio 2014

lunes, 28 de julio de 2014

Deducción de la ecuación de Michaelis-Menten.

Según la teoría general de la acción enzimática, de Michaelis-Menten, la enzima (E) se combina en primer lugar de forma reversible con su sustrato formando un complejo enzima-sustrato (ES) en un paso reversible relativamente rápido. El complejo ES se descompone seguidamente en un segundo paso más lento dando la enzima libre y el producto (P) de la reacción:

Podemos definir la velocidad de la reacción como:

$v=k_{2}\cdot \left [ ES \right ]-k_{-2}\cdot \left [ E \right ]\cdot \left [ P \right ]$

Consideración 1:

En condiciones de velocidad inicial $\left [ P \right ]_{t=0}=0$

$\Rightarrow \left [ S \right ]_{t=x}=\left [ S \right ]_{t=0}$

y $\left [ S \right ]_{t=x}> > > \left [ P \right ]_{t=x}$

$\Rightarrow k_{-2}\cdot \left [ E \right ]\cdot \left [ P \right ]=0\therefore$ se puede despreciar la reacción inversa.

$\Rightarrow v_{0}=k_{2}\cdot \left [ ES \right ]$

$\left [ ES \right ]$ no se puede conocer!!!

Consideración 2:

$\left [ S \right ]> > > \left [ E \right ]$

Balance de masa: $\left [ S \right ]_{total}=\left [ S \right ]_{libre}+\left [ ES \right ]$

$\Rightarrow \left [ S \right ]> > > \left [ E \right ]\Rightarrow \left [ ES \right ]$ es despreciable.

$\Rightarrow \left [ S \right ]_{total}=\left [ S \right ]_{libre}$

Cinética del estado estacionario:

velocidad de formación $\left [ ES \right ]$ = velocidad de descomposición $\left [ ES \right ]$

$\frac{\mathrm{d} \left [ ES \right ]}{\mathrm{d} t}=-\frac{\mathrm{d} \left [ ES \right ]}{\mathrm{d} t}$

o:

$\frac{\mathrm{d} \left [ ES \right ]}{\mathrm{d} t}=0$

$\frac{\mathrm{d} \left [ ES \right ]}{\mathrm{d} t}=k_{1}\cdot \left [ E \right ]\cdot \left [ S \right ]$

$-\frac{\mathrm{d} \left [ ES \right ]}{\mathrm{d} t}=k_{-1}\cdot \left [ ES \right ]+k_{2}\cdot \left [ ES \right ]=\left [ ES \right ]\cdot \left ( k_{-1} +k_{2}\right )$

$\Rightarrow k_{1}\cdot \left [ E \right ]\cdot \left [ S \right ]=\left [ ES \right ]\cdot \left ( k_{-1} +k_{2}\right )$

Por balance de masa: $\left [ E \right ]_{T}=\left [ E \right ]+\left [ ES \right ]$

$\left [ ES \right ]=\frac{k_{1}\cdot \left [ E \right ]_{T}\cdot\left [ S \right ]}{k_{-1}+k_{2}+k_{1}\cdot \left [ S \right ]}=\frac{k_{1}\cdot \left [ E \right ]_{T}\cdot \left [ S \right ]}{k_{1}\cdot \left \{ \left ( \frac{k_{-1}+k_{2}}{k_{1}} \right ) +\left [ S \right ]\right \}}$

$\Rightarrow \left [ ES \right ]=\frac{\left [ E \right ]_{T}\cdot \left [ S \right ]}{\frac{k_{-1}+k_{2}}{k_{1}}+\left [ S \right ]}$

Constante de Michaelis:

$K_{M}=\frac{k_{-1}+k_{2}}{k_{1}}$

$\Rightarrow \left [ ES \right ]=\frac{\left [ E \right ]_{T}\cdot \left [ S \right ]}{K_{M}+\left [ S \right ]}$

De esta manera es posible calcular:

$v_{0}=k_{2}\cdot \left [ ES \right ]=\frac{k_{2}\cdot \left [ E \right ]_{T}\cdot \left [ S \right ]}{K_{M}+\left [ S \right ]}$

Dado que la velocidad máxima se obtendrá cuando la enzima está saturada, es decir cuando [ES]=[E]_T

entonces podemos definir $v_{m\acute{a}x}=k_{2}\cdot\left[E\right]_{T}$

Dando así la ecuación de Michaelis-Menten.

$v_{0}=\frac{v_{m\acute{a}x}\cdot\left[S\right]}{K_{M}+\left[S\right]}$

La ecuación de Michaelis-Menten es la ecuación de velocidad de una reacción catalizada enzimáticamente con un sustrato.

jueves, 24 de julio de 2014

5 Bioenergética y tipos de reacciones bioquímicas

Notas: https://mega.co.nz/#!MVEHxQ4Q!OmzSKkE2m7cVNeGvuacwikMgMoryxiytHYKvTP8opzw

sábado, 19 de julio de 2014

4 Lípidos

Notas: https://mega.co.nz/#!0dlymRpQ!UXwuaRogNEBv6AiIZ2Dq6vwbiusmDSJJrDyTa8rvq9k

lunes, 14 de julio de 2014

Estructuras de Haworth.

Estructuras de Haworth para las cetosas.

Se cierra el anillo entre el O del grupo -OH del C₅ que pasará a formar parte del ciclo, y el grupo C=O del C₂. Resultando una estructura cíclica de 5 miembros que se representa en perspectiva, en donde la parte con trazo grueso se ubica hacia adelante, y los restos por arriba o por debajo del plano. El C₂, C anomérico, se coloca a la derecha, los C₃ y los C₄ hacia delante, el C₅ a la izquierda y el O del anillo hacia atrás.
El átomo de O hemiacetálico se dibuja siempre hacia atrás a la derecha.
Los restos que en las formas hemiacetálicas están hacia la derecha en las proyecciones de Haworth van hacia abajo, y los que están hacia la izquierda colocarán hacia arriba del plano del anillo.
Para los hidratos de carbono de la serie D el grupo terminal -CH₂OH va hacia arriba y en la serie L hacia abajo del plano del anillo.
El -OH anomérico se coloca hacia abajo del mencionado plano en las formas α y hacia arriba en las formas β.

Desde el punto de vista conformacional el ciclopentano prácticamente no tiene tensión angular, pero sí presenta gran tensión torsional. En consecuencia se tuerce y adopta una conformación no plana, en donde cuatro de los átomos de C se encuentran más o menos en el mismo plano y el 5° se sale de éste (conformación de sobre). En su mayor parte los H están casi alternados respecto a sus vecinos.

Estructuras de Haworth para las aldosas.

Se cierra el anillo entre el O del grupo -OH, que pasará a formar parte del ciclo, y el C que contiene al grupo -HC=O en el C1. Resultando una estructura cíclica de 6 miembros que es perpendicular al plano del papel y por lo tanto se representa en perspectiva, en donde la parte con trazo grueso se ubica hacia adelante y los restos por arriba o por debajo del plano. El C1 se coloca a la derecha, los C2 y C3 hacia adelante, el C4 a la izquierda y el C5 y el O del anillo hacia atrás.
El átomo de O hemiacetálico se dibuja siempre hacia atrás y a la derecha.
Los restos que en las formas hemiacetálicas están hacia la derecha en las proyecciones de Haworth van hacia abajo, y los que están hacia la izquierda se colocarán hacia arriba.
Para los hidratos de carbono de la serie D los grupos terminales -CH₂OH van hacia arriba y en la serie L van hacia abajo.

Cuando se produce la ciclación del grupo C=O plano da origen a un C asimétrico (obsérvese los 4 restos que presenta), donde la orientación del grupo -OH del hemiacetal puede ser hacia arriba o hacia abajo del plano del anillo. Estas dos orientaciones del grupo -OH dan lugar a los productos diasterómeros denominados anómeros y al C hemiacetálico se lo denomina C anomérico. En los anómeros α el -OH del C anomérico está hacia abajo (axial en la conformación silla), y en el anómero β hacia arriba (ecuatorial en la conformación silla).

Giros de las estructuras de Haworth.
Existen dos maneras de girar las estructuras, respetando las reglas:
a) Rotación en 180°
b) Inversión del plano al revés